吉隆坡有两个机场，分别是吉隆坡国际机场(Kuala Lumpur International Airport，代码KUL)和苏邦机场(Subang Airport，代码SZB)。吉隆坡国际机场是最主要的国际机场，游客一般在这里出入境，而苏邦机场则主要负责国内航线。

吉隆坡国际机场位于市区以南约50km、约1小时车程。两座航站楼分别为KLIA和KLIA2，相距不到2km，且有便捷交通相连。KLIA2是以前的吉隆坡廉价机场(LCCT)，亚航所有航班(无论国内或国际航班)都在KLIA2起降，机票信息上显示“2”这个数字;除亚航外的其他非廉价航空如马航、国航、南航等则在KLIA起降，机票信息显示“M”这个字母。

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