京都大学的起源是1861年(文久元年)，在长崎设立的长崎养生所(之后改称为长崎精得馆)，京都大学是继东京大学之后成立的日本第二所国立大学。

　　1869年建校

　　1870年理学学校1869年开设了洋学校合并

　　1897年6月18京都帝国大学成立

　　1897年理工科大学被设置

　　1898年法工科大学被设置

　　1899年医科大学被设置

　　1906年文科科大学被设置

　　1919年经济学部法学部分离独立

　　1923年农学部的设置和学部的增设相继

　　1926年附置研究所于化学研究所设立

　　1946年女子的入学认可了创立五十周年

　　1947年大学名“帝国”被削减，京都大学改称

　　1992年総合人间学部设置，现行的大学组织的形式被改编

　　1997年京都大学建校一百周年迎

　　2004年根据时代的变化我国的改革之一国立大学法人法被实施其规定京都大学，国立大学法人改组。

　　这样，京都大学就成了在日本仅次于东京大学的学科齐全、规模宏大的国立综合大学。

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