安徽医科大学截至2014年4月，该校拥有2个博士学位授权一级学科点，共26个博士学位授权学科点，拥有临床医学博士专业学位授予权，有10个硕士学位授权一级学科点，74个硕士学位授权学科点。

　　建立了3个博士后科研流动站。皮肤病与性病学为国家重点学科，中药药理学、中医肿瘤病学为国家中医药重点学科，有12个国家临床重点专科，19个省级重点学科，42个省级临床医学重点学科和重点扶持学科。

　　在ESI(基本科学指标数据库)中，该校临床医学学科排名全球前1% 。

　　博士后科研流动站(3个)：药学、临床医学、公共卫生与预防医学

　　博士学位授权一级学科点(2个)：临床医学、药学

　　博士学位授权学科点(26个)：免疫学、内科学、儿科学、老年医学、神经病学、精神病与精神卫生学、皮肤病与性病学、影像医学与核医学、临床检验诊断学、外科学、妇产科学、眼科学、耳鼻咽喉科学、肿瘤学、康复医学与理疗学、运动医学、麻醉学、急诊医学、流行病与卫生统计学、儿少卫生与妇幼保健学、药物化学、药剂学、生药学、药物分析学、微生物与生化药学、药理学

　　硕士学位授权一级学科点(10个)：心理学、生物学、生物医学工程、基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、药学、中药学、护理学

　　专业学位点(6个)：临床医学博士专业学位、临床医学硕士专业学位、口腔医学硕士专业学位、公共卫生硕士专业学位、药学硕士专业学位、中药学硕士专业学位

　　省级重点学科(19个)：药理学、病原生物学、免疫学、病理学与病理生理学、儿少卫生与妇幼保健学、口腔临床医学、社会医学与卫生事业管理、中药学、老年医学、内科学(消化系病、传染病、血液病)、神经病学、外科学(泌尿外、骨外、普外)、妇产科学等

　　国家临床重点专科(12个)：呼吸内科、神经内科、泌尿外科、皮肤科、急诊科、麻醉科、病理科等

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