荆州博物馆获得过的荣誉如下：地县级十佳优秀博物馆之首、全国文化先进集体、国家旅游局4A级旅游单位称号、荆州市创建湖北省森林城市工作先进单位等。

1993年，荆州博物馆被国家文物局评为地县级十佳优秀博物馆之首。1995年，被文化部、人事部命名为全国文化先进集体。1999年，《江汉平原楚汉文化展》荣获国家文物局“全国十大陈列展览精品奖”。2000年，荆州博物馆荣获国家旅游局4A级旅游单位称号。2003年，该馆“马山一号墓战国楚墓丝织物的保护研究”获湖北省科技进步二等奖。 2016年8月，该馆荣获“荆州市创建湖北省森林城市工作先进单位”荣誉称号。

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