卓尼县海拔在2000-4920米之间。卓尼县，隶属于甘肃省甘南藏族自治州，位于青藏高原的东部边缘，甘肃省甘南藏族自治州东南部，全县总面积5419.68平方公里。卓尼县境内有306省道穿境，有大峪沟、禅定寺等旅游景区。

卓尼县地处青藏高原的东部边缘，位于甘肃省甘南藏族自治州东南部，东邻定西市岷县、漳县，南接甘南州迭部县，西南与四川省阿坝藏族羌族自治州若尔盖县为邻，西通甘南州碌曲县、合作市，北靠临夏回族自治州和政、康乐及定西市渭源县、漳县接壤，中部与甘南州临潭县交错环接。

卓尼县地处青藏高原东部边缘，大部分为中低山山地丘陵地形。主要山脉仅有1条，即西倾山脉，属昆仑中支巴颜喀拉山余脉，又是秦岭山脉的西段，西倾山脉自青海延伸入甘肃境内后即析为南、中、北三支，此三支均延伸至卓尼境内，大多呈东西走向，境内最高峰扎伊克嘎位于县境南部边境，海拔4920米，最低点柳林位于东部藏巴哇乡，海拔2000米。

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