火车站有三个：赣州总站，赣州东站(在赣县)，赣州南站(在南康)。

赣州火车站，1996年建立，位于江西省赣州市章贡区五洲大道31号，位于京九铁路、赣龙铁路、赣龙铁路复线、赣韶铁路线上，隶属南昌铁路局赣州车务段管辖，现为一等站，是最繁忙的车站之一。

赣州东站站址在江西省赣州市赣县区梅林镇，邮政编码341100。建于1996年。隶属南昌铁路局赣州车务段管辖。现为二等站。

赣州南站位于江西省赣州市潭东镇。不办理旅客乘降;行李、包裹托运。货运：办理整车货物发到;危险货物仅办理农药、化肥发到。