2017年末全市共有中小学校117所，中小学在校学生7.95万人，普通中小学专任教师6048人。其中：普通中学42所，同比持平;普通小学75所，同比减少16所。幼儿园86所，同比增加8所。小学学龄儿童入学率达100%。

巢湖学院

　　巢湖学院是安徽省属全日制普通本科院校，创建于1977年，前身是巢湖师范专科学校。2002年4月，经教育部批准，升格为本科院校，更为现名。2013年6月，顺利通过教育部本科教学工作合格评估。

巢湖市第一中学

　　巢湖市第一中学是一座历史悠久、文化底蕴深厚的百年名校。其前身为历经清、民两代的巢湖书院，1905年改为“巢县高等小学堂”;1911年改为“巢县官立中学堂”，于1947年增设高中部，定名“巢县中学”，后用“巢湖市第一中学”校名至今。

巢湖市第二中学

　　系安徽省示范高中，前身为1947年创办的私立皖光初级中学;1952改为公办学校，先后更名为巢县初级中学(1952-1959年)、巢县第二中学(1960-1968年，1960年增设高中部)、巢城中学(1969-1970年，与巢县一中合并)、巢县第二中学(1971-1983年)、巢湖市第二中学(1984年至今)。先后被评定为安徽省重点初中、巢县重点中学、巢湖地区重点中学、巢湖市示范完中、安徽省示范高中。

巢湖市第三中学

　　巢湖市三中，始建于1979年10月。前身为巢湖市朝阳学校，位于老城区东山头，建制为完中，24个教学班。1981年，朝阳学校高中部迁入现校区，定名为巢县三中。1984年，新校区初中部正式招生，同年，命名为巢湖市第三中学。

巢湖市第四中学

　　巢湖市四中创建于1972年8月，原名巢县东方红中学，1984年8月更名为巢湖市第四中学。2000年12月学校被评定为“巢湖市示范完中”，2005年4月被省教育厅命名为“安徽省示范性普通高中”。2013年9月，市一中、市二中、市四中高中招生实施三校联招。