嘉兴本科大学有同济大学浙江学院，嘉兴学院， 嘉兴医学院（本科，专科都有）。

同济大学浙江学院（TongJi ZheJiang College），位于浙江省嘉兴市，学院创建于2008年5月，是经国家教育部正式批准成立，由同济大学、嘉兴市教育发展投资有限责任公司、宏达控股集团合作举办，是一所按新机制和新模式运作的具有独立法人资格、举办全日制本科学历教育的独立学院。

嘉兴学院（Jiaxing University），简称嘉院，位于浙江省嘉兴市，是2000年3月经国家教育部批准，由原浙江经济高等专科学校和嘉兴高等专科学校（湖州师范学院前身）合并组建的普通本科高校，实行“省市共建共管，以省为主”的管理体制。此后平湖师范学校、嘉兴卫生学校、浙江会计学校和嘉兴市粮食干部学校等四校相继并入。

医学院为嘉兴学院的二级学院，现有在校学生1680人。学院下设临床医学一系、临床医学二系、护理系和药学系；目前设有临床医学、护理学和药学三个本科专业。